A SEBRAE disponibiliza gratuitamente um programa emissor de notas fiscais eletrônicas. Segue o link para fazer download do software e manuais. Clique abaixo.
A seguir temos um artigo muito completo publicado pela Serasa Experian onde encontra-se informações sobre quando uma MEI necessita ter certificado digital. Atente para o detalhe que um certificado digital tipo e-MEI não permite a emissão de notas fiscais eletrônicas. Para este caso utilize o e-CNPJ.